Aufklärung der genetischen Regulierung der Immunantwort auf eine SARS-CoV-2-Infektion mit Hilfe von Einzelzell-omics-Ansätzen
Projektleiterin: Prof. Dr. Yang Li
Schlüsselbereiche
- Digitale Infektionsmedizin: Individualisierte Patientenversorgung
- Pathophysiologie: Immunmodulation und -kontrolle
Wer ist beteiligt?
- Prof. Dr. Yang Li (Projektleiterin, CiiM)
- Prof. Dr. med. Markus Cornberg (MHH)
Was ist das Ziel?
Frühere Studien haben gezeigt, dass der Schweregrad der Erkrankung und die Immunantwort bei COVID-19-Patient*innen sehr unterschiedlich sind. Um die funktionellen Zusammenhänge zwischen molekularen Faktoren und ihren Wechselwirkungen, die die Immunantwort auf SARS-CoV-2 bestimmen, systematisch zu bewerten, werden wir in diesem Projekt "systemimmunologische Ansätze" auf ein breites Spektrum von Multi-omics-Daten anwenden, einschließlich DNA-Variation, Epigenetik, Transkriptom und Krankheitsphänotypen von COVID-19-Patient*innen. Wir werden Schlüsselgene von Immunwegen und epigenetische Marker identifizieren, die durch COVID-19 induziert werden, sowie die Immunzelltypen, in denen sie ihre Wirkung entfalten und die genetischen Regulierungsnetze rekonstruieren, die der COVID-19-Infektion zugrunde liegen. Dieses Projekt wird die Entwicklung einer personalisierten Medizin und die Prävention von Infektionskrankheiten einschließlich COVID-19 erleichtern.
Publikationen
- Altered and allele-specific open chromatin landscape reveals epigenetic and genetic regulators of innate immunity in COVID-19. Zhang, B., Zhang, Z., Koeken, V.A.C.M., Kumar, S., Aillaud, M., Tsay, H.-C., Liu, Kraft, A.R.M., Soon, C.F., Odak, I., Bošnjak, B., Vlot, A., Deutsche COVID-19 OMICS Initiative (DeCOI), Swertz, M.A., Ohler, U., Geffers, R., Illig, T., Huehn, J., Saliba, A.E., Sander, L.E., Förster, R., Xu, C.-J., Cornberg, M., Schulte, L.N., Li, Y. Cell Genomics, December 2, 2022. https://doi.org/10.1016/j.xgen.2022.100232